Alle documenten die binnen WaterPro worden aangemaakt, of dat nu emails en contactverslagen of procesgerelateerde documenten zijn, worden in WaterPro opgeslagen. Hiervoor is een aparte documentendatabase beschikbaar, waar alle documenten op type, datum, relatie en behandelaar te sorteren zijn. Daarnaast zijn deze documenten ook altijd via de betreffende relatie, locatie of lopend proces terug te vinden.
 
Als u reeds een Document Management Systeem (DMS) in gebruik heeft, zoals bijvoorbeeld Corsa, Decos, Verseon of Hummingbird, kan WaterPro ook gebruik maken van de faciliteiten van dat systeem. Er zijn koppelingen beschikbaar waardoor de relevante documenten binnen uw in gebruik zijnde DMS worden bewaard.
 
Naast de documentopslag in WaterPro worden de documenten ook aangemaakt binnen de applicatie. Met behulp van sjablonen en bladwijzers wordt op basis van de selecties automatisch het document aangemaakt, en hoeft de gebruiker alleen de inhoud van het document toe te voegen. Alle relevante stuurinformatie is reeds aanwezig. Documenten worden indien gewenst automatisch geconverteerd naar PDF of andere bestandstypen.