Het is ook mogelijk om het watertoetsproces te automatiseren binnen WaterPro, van initiatief tot besluitvorming. Instanties en locaties worden dan gekoppeld aan de watertoets. De medewerkers hebben direct inzicht in lopende vergunningen, aanvragen en Keur. Op deze wijze kan gegarandeerd worden dat het water de ruimte krijgt in ruimtelijke plannen.